Знак ордена «За военные заслуги» из серебра с эмалью. Он представляет собой восьмиконечную звезду, диагональные лучи которой образуют пятиугольники, покрытые эмалью цветов Государственного флага Российской Федерации. На центральном медальоне, по кругу, — венок из дубовых и лавровых ветвей и рельефная надпись: «За военные заслуги». В центре медальона — рельефное изображение Государственного герба Российской Федерации. Диаметр знака ордена — 40 мм. На оборотной стороне знака — номер ордена.
Знак ордена при помощи ушка и кольца соединяется с пятиугольной колодкой, обтянутой шелковой муаровой лентой синего цвета с красной полоской по центру между двух белых полосок. Ширина ленты — 24 мм, ширина красной полоски — 5 мм, ширина белых полосок — 2 мм.
Указом Президента Российской Федерации от 16 декабря 2011 года № 1636 в Статут ордена внесено дополнение:
На ленте ордена «За военные заслуги» в виде розетки крепится миниатюрное изображение знака ордена из металла с эмалью. Расстояние между концами звезды — 13 мм. Диаметр розетки — 15 мм.
Первое награждение: 31 декабря 1994 года, командующий Объединенной группировкой федеральных войск в Чечне генерал-лейтенант Анатолий Романов.
Последнее награждение: 2 февраля 2013 года, гендиректор ЗАО «Научно-производственное объединение специальных материалов» (Санкт-Петербург) Михаил Сильников.