23 сентября 1999 года президент России Борис Ельцин подписал указ «О мерах
по повышению эффективности контртеррористических операций на территории
Северо-Кавказского региона Российской Федерации», предусматривавший создание Объединенной группировки войск на Северном Кавказе. В тот же день российская авиация произвела бомбардировку Грозного, а 30 сентября началась наземная операция: танковые подразделения российской армии вошли на территорию Наурского и Шелковского районов Чечни.

К этому времени боевые действия на Северном Кавказе шли уже больше месяца - они начались после вторжения в Дагестан вооруженных групп под руководством Шамиля Басаева и Хаттаба. Федеральные власти обвинили президента Чеченской республики Ичкерия Аслана Масхадова в неспособности контролировать ситуацию. Владимир Путин, занимавший тогда должность председателя правительства, заявил, что если чеченское руководство не может предотвратить переход бандитских группировок через границу Чечни, то для предотвращения распада России проблему борьбы
с террористами возьмут на себя специалисты.

В апреле 2000 года было объявлено о завершении войсковой части контртеррористической операции в Чечне и переходе к спецоперациям. Потери боевиков были оценены в 14 000 человек. Контртеррористическая операция продолжалась еще девять лет. К началу 2005 года, после уничтожения Масхадова, Хаттаба, Бараева, Абу аль-Валида и многих других полевых командиров террористов, интенсивность диверсионно-террористической деятельности боевиков значительно снизилась. За 2005-2008 годы в России не было совершено ни одного крупного теракта, а единственная масштабная операция боевиков (Рейд на Кабардино-Балкарию
13 октября 2005 года) завершилась полным провалом. Лишь 16 апреля 2009 года
по поручению Дмитрия Медведева контртеррористическая операция в Чечне была отменена.

Согласно официальной статистике Министерства обороны РФ, за период войны
с 1999 по 2008 годы на Северном Кавказе погибли 3 684 военнослужащих российской армии, а по данным МВД РФ более 2 000 сотрудников правоохранительных органов
и внутренних войск также стали жертвами этого конфликта.