Полотнище штандарта квадратное, белого цвета. В центре каждой стороны полотнища - эмблема 12 Главного управления Министерства обороны Российской Федерации.  От центра к углам каждой стороны полотнища расходятся сине-красные лучи: синего цвета - к боковым краям полотнища, красного - к верхнему и нижнему. Ширина лучей по краям полотнища равна 1/4 его ширины.