Флаг Войск радиационной, химической и биологической защиты представляет собой прямоугольное двустороннее полотнище. Рисунок лицевой и оборотной сторон полотнища одинаков и представляет собой четырехконечный крест белого цвета с расширяющимися концами и с равноразделенными между концами креста желто-черно-желтыми углами.

В центре полотнища – изображение правильного контурного золотого шестиугольника, в черном поле которого три расходящихся золотых луча с четырьмя взаимопересеченными красными кольцами в нижней части, на серебряных диагонально перекрещенных пламенеющей стреле и дымовом факеле.

Отношение ширины флага к его длине 2:3. Расстояние между верхними (нижними) концами стрелы и факела соответствует ширине флага. Отношение ширины шестиугольника к длине флага 1:4.