Флаг Инженерных войск представляет собой прямоугольное двустороннее полотнище. Рисунок лицевой и оборотной сторон полотнища одинаков и представляет собой четырехконечный крест белого цвета с расширяющимися концами и с равноразделенными между концами креста красно-черно-красными углами.

В центре полотнища – изображение серебряных отвала путепрокладчика, якоря, пылающей гренады с молниями и перекрещенных топоров, обрамленных сверху зубчатым колесом. 

Отношение ширины флага к его длине составляет 2:3, отношение ширины изображения к длине флага – 1:3.