Флаг Войск радиоэлектронной борьбы представляет собой полотнище белого цвета прямоугольной формы. Отношение ширины флага к его длине составляет 2:3. От центра полотна к углам расходятся четыре черно-сине-черных луча, расширяющихся по мере приближения к границам флага. В самом центре, перекрывая перекрестье лучей, размещена малая эмблема Войск радиоэлектронной борьбы - изображение руки в золотой лате, сжимающей золотые молнии, на фоне земного шара голубого цвета с золотыми меридианами и параллелями.

Элементы эмблемы символизируют:

- земной шар (символ единства) - международный характер задач, решаемых Управлением радиоэлектронной борьбы;

- рука в золотой лате (символ защиты), сжимающая золотые молнии (символ силы и борьбы), - основные функции Управления радиоэлектронной борьбы в организации решения задач радиоэлектронной борьбы в Вооруженных Силах Российской Федерации и планировании боевого применения сил и средств радиоэлектронной борьбы.