Родился 9 сентября 1860 года. 12 апреля 1881 года окончил Морской корпус с производством в чин гардемарина и 31 мая следующего года был произведён в чин мичмана.

В 1886—1889 годах занимал должность адъютанта 8-го флотского экипажа и 24 апреля 1888 года был произведён в чин лейтенанта. В октябре-декабре 1888 года командовал 1-й ротой 8-го флотского экипажа, а с 9 февраля 1889 года командовал 9-й ротой броненосца «Император Александр II». 

В 1896 году окончил Минный Офицерский класс и был зачислен в минные офицера 1-го разряда. 6 декабря 1898 года назначено содержание по чину капитан-лейтенанта. С 10 января 1899 года по 18 апреля 1900 года командовал миноносцем № 120, после чего был переведён на должность старшего офицера крейсера «Новик». 6 декабря 1901 года произведён в капитаны 2-го ранга. 

1 января 1904 года отчислен от должности старшего офицера и назначен командиром крейсера «Гайдамак». 18 марта, после непродолжительного командования «Гайдамаком», Иванов был переведён на должность командира минного транспорта «Амур». Произвел удачную постановку минного заграждения, приведшую к гибели двух эскадренных броненосцев противника, за что был награждён орденом Св. Георгия 4-й степени. 24 августа был назначен командиром крейсера «Баян», которым командовал до затопления его 26 ноября того же года.

6 декабря 1906 года был произведён в чин капитана 1-го ранга. После окончания русско-японской войны командовал крейсерами «Очаков» и «Баян». В 1909—1910 годах командовал отрядом заградителей Балтийского моря.

С 6 октября 1912 года Иванов участвовал в особой комиссии по организации прибрежной обороны. 7 мая 1913 года командовал 1-м флотским экипажем, а в следующем году был произведён в контр-адмиралы.

19 января 1915 года Фёдор Николаевич был произведён в чин вице-адмирала с увольнением в отставку.

Дальнейшая судьба неизвестна.