Родился 15 февраля 1913 года в деревне Смольниково Волоколамского района Московской области в крестьянской семье. Был зачислен курсантом Высшего Военно-морского училища имени М. В. Фрунзе. Училище окончил в 1937 году и был назначен на Тихоокеанский флот командиром батареи БЧ-2 на сторожевой корабль «Бурун». В сентябре 1938 г. был направлен на курсы командиров миноносцев командного состава ВМФ. В июле 1939 года Лобов назначается помощником командира на строящийся эсминец «Резкий». В июне 1942 года С. М. Лобов назначен командиром эсминца «Резвый». 

В ходе войны с Японией «Резвый» обеспечивал высадку десантов и поддерживал артиллерийским огнем приморские части сухопутных войск. 

В ноябре 1946 года Лобова переводят служить на Черноморский флот. Его назначили командиром 1-го дивизиона бригады миноносцев. В состав дивизиона входили Краснознаменные эсминцы «Сообразительный» и «Бойкий», эсминец «Бодрый». В 1947 году С. М. Лобов награжден орденом Красной Звезды.

В мае 1948 года С. М. Лобов вступает в командование Краснознаменным крейсером «Ворошилов». В январе 1949 года С. М. Лобов принял участие в приемке в Албании легкого крейсера Duca D’Aosto бывшего итальянского флота. В 1949 году С. М. Лобов был награжден орденом Красного Знамени. 13 июня 1950 года Лобову было досрочно присвоено звание капитана 1 ранга.

В сентябре 1951 года С. М. Лобов назначается командиром Краснознаменного линкора «Севастополь». В 1953 году С. М. Лобов награжден Орденом Красного Знамени. В декабре 1953 Семён Михайлович Лобов направился на Академические курсы офицерского состава при Военно-морской Академии. Ему было присвоено звание контр-адмирала, которое он получил во время учёбы 31 мая 1954.

С октября 1955 по июнь 1957 года является начальником штаба эскадры, с июня 1957 по октябрь 1960 года — командующим эскадрой. Проходит Академические курсы офицерского состава при Военно-морской Академии (АКОС при ВМА) (с октября 1960 по июль 1961 года).

С июля по октябрь 1961 года находится в распоряжении главкома ВМФ. С октября 1961 по июнь 1964 года — 1-й заместитель Командующего, и ЧВС флота.

С мая 1972 по июль 1977 года находится на должности помощника начальника Генштаба ВС СССР по ВМФ. Активно участвовал в работе по укреплению боеготовности флотов, разработке новых приемов использования разнородных сил ВМФ, в организации испытаний и ввода в строй новых кораблей, боевой техники и вооружений.

Умер 12 июля 1977 года в Москве. Похоронен на Новодевичьем кладбище.