Родился 20 ноября 1911 года в деревне Бабурино Киржачского района Владимирской области. В ВМФ с 1933 года, когда его призвали на флот, в учебный отряд подводного плавания в Ленинграде. В 1938 году назначен военкомом подводной лодки на Тихоокеанском флоте. 

В годы Великой Отечественной войны капитан 2 ранга Федор Яковлевич Сизов прошёл суровую школу флотской закалки.

В 1947 – 1953 годы служил в главном политуправлении ВМФ, с 1954 года - заместителем начальника политуправления ВМФ.

С 1961 года на Северном флоте адмирал Федор Яковлевич Сизов занимается вопросами обучения и воспитания североморцев. Внёс большой вклад в развитие флотской культуры.

С апреля 1974 года в запасе по болезни.

Погиб 18 марта 1977 года в автомобильной катастрофе. Похоронен в Москве на Кунцевском кладбище.